Хяналт шалгалтын систем нь ХКН-ын доторх чухал систем бөгөөд тусгай хяналтын байгууллагуудыг байгуулах замаар доод шатны намын байгууллагуудын удирдлага, тэдгээрийн гишүүдийн удирдлагад зохих журмын дагуу хяналт тавьж ажилладаг төв, муж, автономит орон, хотын намын хороодын тогтолцоог хэлдэг.
2003 онд эргүүл хяналт шалгалтын тогтолцоог намын дотоод журам хэлбэрээр намын хяналт шалгалтын 10 журмын нэг гэж баталсан бөгөөд 2007 онд ХКН-ын 17-р их хурлаар эргүүл хяналт шалгалтын тогтолцоог намын үндсэн хуульд оруулсан бөгөөд 2009 онд Төв Хороо 《ХКН-ын эргүүл хяналт шалгалтын ажлын журам (туршилтын) 》 ыг гаргаж, 2015 оны 08-р сард Төв Хороо 《ХКН-ын эргүүл хяналт шалгалтын ажлын журам》 , 2017 оны 05-р сард Төв Хорооны Улс төрийн товчоо《ХКН-ын эргүүл хяналт шалгалтын ажлын журамд нэмэлт өөрчлөлт оруулах тухай шийдвэр 》 -г хянан хэлэлцэж, 07-р сарын 01-нд албан ёсоор зарласан байна. Журамд зааснаар хяналт шалгалтын ажил нь төв хорооны нэгдсэн удирдлага дор зэрэглэлд хуваан хариуцах бөгөөд баримтаас үнэнийг эрэлхийлэх зарчим баримталж, хуулийн дагуу, ард олны чигч шугамыг баримтална, ардчиллыг дэмжиж; хяналт шалгалтын ажлыг гүйцэтгэдэг намын байгууллага нь шалгалтын ажлын үндсэн үүргийг хариуцна; хяналтын хэсгийн үндсэн үүрэг доод шатны намын удирдлагын баг ба түүний гишүүдэд хяналт тавих ажлыг зохион байгуулна, хяналт шалгалтын арга нь тусгай шалгалт бөгөөд “эргэж харах”, “механик” үзлэг гэх зэрэг шалгалтын арга орно.
ХКН-ын 18-р их хурал эхэлснээс хойш Төв Хороо төв, мужийн намын хороодын үйл ажиллагааг бүрэн хамарсан эргүүлүүдийг хэд хэдэн удаа зохион байгуулж, эргүүлийн үр нөлөөг онцолсон байна. хяналт шалгалтын тогтолцоо нь үр дүнтэй, хэрэгтэй болохыг практик баталлаа.
Хяналтын ажил нь намын ажлын хэв маяг, цэвэр төрийн байгуулалт, авлигын эсрэг тэмцлийн чухал платформ болж, намын дотоод хяналтыг олон нийтийн хяналттай хослуулах нь чухал юм. Дээд төвшний намын байгууллагууд доод шатны намын байгууллагуудад хяналт тавих чухал эхлэл болж, намыг цогц, хатуу удирдлагаар хангаж хүчтэй дэмжлэг болж өгч байна.